Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sec23aQ01405 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms