Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2aQ01320 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms