Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HmgcrQ01237 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms