Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelpQ01102 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SelpQ01102 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelpQ01102 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms