Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms