Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Serpina1cQ00896 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Serpina1cQ00896 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms