Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfaQ00731 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VegfaQ00731 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms