Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd80Q00609 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd80Q00609 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms