Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms