Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba2P98084 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apba2P98084 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba2P98084 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms