Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc1P98083 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shc1P98083 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms