Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfdP97946 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfdP97946 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms