Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama4P97927 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama4P97927 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lama4P97927 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama4P97927 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms