Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms