Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms