Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h3bP84228 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms