Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms