Protein–RNA interactions for Protein: P81270

Erg, Transcriptional regulator ERG, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErgP81270 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErgP81270 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErgP81270 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErgP81270 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErgP81270 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErgP81270 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErgP81270 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErgP81270 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErgP81270 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErgP81270 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ErgP81270 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErgP81270 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ErgP81270 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErgP81270 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErgP81270 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErgP81270 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErgP81270 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErgP81270 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErgP81270 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErgP81270 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ErgP81270 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ErgP81270 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ErgP81270 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ErgP81270 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ErgP81270 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ErgP81270 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ErgP81270 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ErgP81270 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ErgP81270 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ErgP81270 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ErgP81270 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ErgP81270 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ErgP81270 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ErgP81270 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ErgP81270 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ErgP81270 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ErgP81270 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ErgP81270 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ErgP81270 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ErgP81270 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ErgP81270 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ErgP81270 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms