Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otx1P80205 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms