Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pitx1P70314 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx1P70314 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms