Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cux2P70298 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cux2P70298 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cux2P70298 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cux2P70298 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cux2P70298 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Cux2P70298 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cux2P70298 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cux2P70298 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cux2P70298 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cux2P70298 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cux2P70298 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cux2P70298 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cux2P70298 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms