Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chl1P70232 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chl1P70232 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chl1P70232 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chl1P70232 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chl1P70232 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms