Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DccP70211 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DccP70211 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DccP70211 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DccP70211 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DccP70211 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DccP70211 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DccP70211 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DccP70211 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DccP70211 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DccP70211 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DccP70211 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DccP70211 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DccP70211 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DccP70211 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DccP70211 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DccP70211 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DccP70211 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DccP70211 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DccP70211 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DccP70211 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DccP70211 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DccP70211 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DccP70211 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DccP70211 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DccP70211 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DccP70211 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DccP70211 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DccP70211 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DccP70211 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DccP70211 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DccP70211 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DccP70211 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DccP70211 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DccP70211 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DccP70211 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DccP70211 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DccP70211 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DccP70211 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DccP70211 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DccP70211 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DccP70211 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DccP70211 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DccP70211 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DccP70211 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DccP70211 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms