Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms