Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbdsP70122 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbdsP70122 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms