Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtnP63089 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtnP63089 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtnP63089 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtnP63089 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtnP63089 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtnP63089 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtnP63089 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtnP63089 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtnP63089 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtnP63089 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtnP63089 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtnP63089 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtnP63089 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtnP63089 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtnP63089 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtnP63089 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtnP63089 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtnP63089 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms