Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms