Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd2P62317 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms