Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm6P62313 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms