Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm3P62311 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms