Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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