Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms