Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga11P61622 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga11P61622 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga11P61622 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga11P61622 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga11P61622 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms