Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Depdc5P61460 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Depdc5P61460 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms