Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme3P61290 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme3P61290 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms