Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms