Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ube2d3P61079 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2d3P61079 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ube2d3P61079 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2d3P61079 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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