Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms