Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms