Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms