Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl3P58873 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl3P58873 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms