Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tm6sf1P58749 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms