Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms