Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc10P56960 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exosc10P56960 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms