Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace1P56818 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace1P56818 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace1P56818 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace1P56818 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace1P56818 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace1P56818 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms