Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms