Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc1a3P56564 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms