Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1P55194 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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