Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtskP55097 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CtskP55097 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtskP55097 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtskP55097 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtskP55097 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtskP55097 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtskP55097 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtskP55097 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms