Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GemP55041 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GemP55041 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GemP55041 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GemP55041 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GemP55041 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GemP55041 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GemP55041 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GemP55041 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GemP55041 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GemP55041 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GemP55041 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GemP55041 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GemP55041 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GemP55041 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms